Фильм "Фонтан" рассказывает о жизни молодого врача-онколога Томми Крео, чья жена, Иза, сталкивается с беспощадным раком. Супруга смирилась с неизбежностью своей смерти, желая лишь большего внимания от мужа. Томми отказывается смириться с утратой и решает найти способ спасти Изу.

Погружаясь в свои исследования, он проводит дни и ночи в лаборатории, стремясь найти лекарство от болезни, которая отняла его семью. Перед уходом Иза оставляет мужу книгу, в которой рассказывается о любви конкистадора Томаса и его поисках Древа Жизни.

Фильм переносит зрителей через три временные линии: в прошлое, на поиски бессмертия; в настоящее, где Томми отчаянно борется за жизнь Изы; и в далекое будущее, где Том отправляется в необычное путешествие к звезде Шибальбе, в надежде на воскрешение души своей возлюбленной.